欧盟国家进行了一次叫做世界末日的实验，为了避免放射性物质污染地球，实验地点被选择在莫洛亚星球上，岩森的六个孩子被称作奥特六兄妹，分别是最大的佐菲。五年级的初代奥特曼 、四年级的赛文，五年级的新曼 （归来曼）二年级的艾斯，还有一年级的云山奥特曼，就在当晚那架飞机被飞蛾袭击爆炸了。艾斯受不了这种丧亲之痛跑了出来。而怪兽则是袭击了一个工厂，不久太阳出来了，飞蛾纷纷飞走，为了保护同伴，云轩变身了，开始展开战斗，这场战斗持续了一年，云山奥特曼在与怪兽的战斗中精疲力尽，终于倒下了，而地球也被黑暗笼罩。但云山也暂时消失了身影。店铺也纷纷关门，这时天空出现一缕七彩光束源源不断，这时，出现一个身影。“小宇，快起来”而那身影的手也在不停的挥动，“快起来，小宇”于是地上的云轩开始慢慢挣扎着起身，“别气馁，现在能从黑暗中拯救地球的除你之外就没有别人了。但要把地球拯救出来秘密就在光之国。你和哥哥们齐心协力去寻找那个秘密吧。”而后云轩变身成云山飞向了自己的故乡光之国。云山幼时曾经豢养过的动物们（白泽（明泽），玄武（煜轩）、小狗拉东）都飞来迎接他了。但云山疑问的是母亲说的那个秘密究竟是什么呢？托龙弹的实验偏离了地球轨道，撞向莫鲁罗亚星，因此惊醒了莫洛亚星上强大的宇宙怪兽，这场战斗维持了整整一年，云山在同莫鲁罗亚勇敢得战斗中精疲力尽。终于倒下了。莫鲁罗亚放出的黑雾笼罩了整个地球。在东京，缺水少食，生活极其困难。而地球的接连出事让ZAT心急如焚，四处巡逻，在一处发现了大量的飞蛾。并展开了攻击，随后怪兽出现了，地球上的建筑都被腐蚀掉了。而怪兽袭击了民航客机使得岩森夫妻俩不幸遇难。留下了六个奥特兄弟姐妹在这一片黑暗的地球上。这时云山奥特曼日夜兼程，终于赶回了遥远的三百万光年的故乡光之国，云山又看到了读过书的小学，和哥哥们一起玩过的游乐场，练习过格斗和光线的训练场以及夏日的游泳池，云山无比的怀念。这时奥特信息来了“小宇，哥哥们在奥特之塔（等离子火花塔）等你——佐菲留”云山很快赶到，并和哥哥们（佐菲、初代、赛文、杰克、艾斯）一一拥抱。佐菲向弟弟们讲述了光之国的历史，（三万年前行星系的中心太阳突然发生了大爆炸，和平安宁的光之国一下子被笼罩在黑暗之中，许多人因为失去光明而死，于是，智慧的蓝族科学家们又设计并研制出了人造太阳【等离子火花】）于是光之国又恢复了以往的宁静与和平，还有光明。可是不久安倍拉星人率领怪兽军团出现在光之国，这一战，凯恩（奥特之父）身受重伤，并认识了玛丽（奥特之母）新的奥特警备队又成立了。为了纪念战争的胜利，光之国的勇士们共同建造了现在看见的奥特之塔，并在熊熊火焰中安放了捍卫宇宙和平的奥特之钟。现在为了拯救我们的第二故乡地球，就必须要借助奥特之钟，只有我们兄弟六人集中力量才能拿到奥特之钟。于是，奥特六兄弟合体了（为了通过燃烧的火焰，六兄弟必须齐心合为一体，才能高密度的通过灼热的火焰。）而奥特之钟被六兄弟纯洁的心灵所感动，但在奥特之钟内奥特六兄弟的生命只能维持两分钟（这还是云山能量能与奥特之钟共鸣的情况下），之后。云山带着奥特之钟飞离故乡，而后将哥哥们脱离出钟。一起朝着地球而去。而地球上的那六兄妹出了车祸，而由于工厂不听劝导致引来了怪兽，而ZAT也在想办法攻击怪兽。终于到了地球，奥特兄弟们在临近地球的宇宙中敲响奥特之钟，终于让地球恢复了蓝天，而憎恶光明并畏惧光明得怪兽莫鲁罗亚此刻气的暴跳如雷。而太郎接受了给怪兽装S1937的任务并成功完成，只是还有30秒无法脱身，这时，云山奥特曼出现了，得知炸弹即将爆炸的消息，便将其扔向空中。莫鲁罗亚成功爆炸，而云山也和哥哥们汇合再与佐菲哥哥依偎将哥哥们送回光之国之后返回地球了。而岩森夫妻的孩子排着队向前跑去